MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 59506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021823	AAAT	2	8	762	769	75 %	25 %	0 %	0 %	525865814
2	NC_021823	GTT	2	6	771	776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865814
3	NC_021823	ATT	2	6	781	786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
4	NC_021823	ATT	2	6	791	796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
5	NC_021823	TAAT	2	8	826	833	50 %	50 %	0 %	0 %	525865814
6	NC_021823	TAT	2	6	861	866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
7	NC_021823	TTC	2	6	1034	1039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865814
8	NC_021823	ATA	2	6	1042	1047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865814
9	NC_021823	A	6	6	1076	1081	100 %	0 %	0 %	0 %	525865814
10	NC_021823	ATT	2	6	1101	1106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
11	NC_021823	ATA	2	6	1114	1119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865814
12	NC_021823	TGG	2	6	1183	1188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525865814
13	NC_021823	ATG	2	6	1195	1200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865814
14	NC_021823	ATA	2	6	1204	1209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865814
15	NC_021823	TTG	2	6	1237	1242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865814
16	NC_021823	ATG	2	6	1255	1260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865814
17	NC_021823	CGAAAT	2	12	1296	1307	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525865814
18	NC_021823	AGA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865814
19	NC_021823	ATG	2	6	1506	1511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865814
20	NC_021823	A	6	6	1628	1633	100 %	0 %	0 %	0 %	525865814
21	NC_021823	TAT	2	6	1708	1713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
22	NC_021823	TAT	2	6	1747	1752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
23	NC_021823	TACA	2	8	1768	1775	50 %	25 %	0 %	25 %	525865814
24	NC_021823	GCTA	2	8	1808	1815	25 %	25 %	25 %	25 %	525865814
25	NC_021823	TTA	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
26	NC_021823	CAC	2	6	1850	1855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525865814
27	NC_021823	TTAT	2	8	1887	1894	25 %	75 %	0 %	0 %	525865814
28	NC_021823	ATGT	2	8	1902	1909	25 %	50 %	25 %	0 %	525865814
29	NC_021823	TGG	2	6	1930	1935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525865814
30	NC_021823	A	6	6	2037	2042	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
31	NC_021823	GCT	2	6	2057	2062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865815
32	NC_021823	GCA	2	6	2103	2108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865815
33	NC_021823	ACC	2	6	2166	2171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525865815
34	NC_021823	ACT	2	6	2194	2199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865815
35	NC_021823	AAG	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
36	NC_021823	AACAA	2	10	2333	2342	80 %	0 %	0 %	20 %	525865815
37	NC_021823	GAAATC	2	12	2346	2357	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525865815
38	NC_021823	A	7	7	2372	2378	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
39	NC_021823	TCTA	2	8	2390	2397	25 %	50 %	0 %	25 %	525865815
40	NC_021823	A	6	6	2521	2526	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
41	NC_021823	CAAA	2	8	2599	2606	75 %	0 %	0 %	25 %	525865815
42	NC_021823	GCA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865815
43	NC_021823	GCG	2	6	2658	2663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525865815
44	NC_021823	AGA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
45	NC_021823	T	6	6	2743	2748	0 %	100 %	0 %	0 %	525865815
46	NC_021823	GAT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865815
47	NC_021823	AGT	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865815
48	NC_021823	A	7	7	2888	2894	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
49	NC_021823	CCAA	2	8	2911	2918	50 %	0 %	0 %	50 %	525865815
50	NC_021823	AAC	2	6	2957	2962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
51	NC_021823	AC	3	6	2977	2982	50 %	0 %	0 %	50 %	525865815
52	NC_021823	AAC	3	9	3014	3022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
53	NC_021823	CA	3	6	3053	3058	50 %	0 %	0 %	50 %	525865815
54	NC_021823	TCA	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865815
55	NC_021823	GCCA	2	8	3077	3084	25 %	0 %	25 %	50 %	525865815
56	NC_021823	CATT	2	8	3153	3160	25 %	50 %	0 %	25 %	525865815
57	NC_021823	A	6	6	3213	3218	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
58	NC_021823	GAA	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
59	NC_021823	CATT	2	8	3433	3440	25 %	50 %	0 %	25 %	525865815
60	NC_021823	GTT	2	6	3471	3476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865815
61	NC_021823	AGA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
62	NC_021823	ATG	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865815
63	NC_021823	A	6	6	3591	3596	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
64	NC_021823	AGA	2	6	3602	3607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
65	NC_021823	AAT	3	9	3636	3644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865815
66	NC_021823	GAC	2	6	3666	3671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865815
67	NC_021823	ACA	2	6	3685	3690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
68	NC_021823	A	6	6	3718	3723	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
69	NC_021823	A	7	7	3733	3739	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
70	NC_021823	AAC	2	6	3748	3753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
71	NC_021823	CAAA	2	8	3818	3825	75 %	0 %	0 %	25 %	525865815
72	NC_021823	TCGGA	2	10	3832	3841	20 %	20 %	40 %	20 %	525865815
73	NC_021823	CAA	2	6	3850	3855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
74	NC_021823	TTG	2	6	3892	3897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865815
75	NC_021823	A	6	6	3930	3935	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
76	NC_021823	GAA	2	6	3951	3956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
77	NC_021823	TAA	2	6	3977	3982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865815
78	NC_021823	AAG	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
79	NC_021823	CGT	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865815
80	NC_021823	CTA	2	6	4047	4052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865815
81	NC_021823	GCCGGA	2	12	4069	4080	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525865815
82	NC_021823	GAG	2	6	4084	4089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525865815
83	NC_021823	GAA	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865816
84	NC_021823	TCA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865816
85	NC_021823	ATT	2	6	4212	4217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865816
86	NC_021823	TTA	2	6	4218	4223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865816
87	NC_021823	T	6	6	4232	4237	0 %	100 %	0 %	0 %	525865816
88	NC_021823	TAT	2	6	4319	4324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865816
89	NC_021823	CAAAT	2	10	4339	4348	60 %	20 %	0 %	20 %	525865816
90	NC_021823	AAG	2	6	4441	4446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865816
91	NC_021823	T	6	6	4543	4548	0 %	100 %	0 %	0 %	525865816
92	NC_021823	TCA	2	6	4591	4596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865816
93	NC_021823	AGATG	2	10	4637	4646	40 %	20 %	40 %	0 %	525865816
94	NC_021823	TTA	2	6	4713	4718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865816
95	NC_021823	GAT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865816
96	NC_021823	TGT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865816
97	NC_021823	GAA	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865816
98	NC_021823	AGA	2	6	5020	5025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865817
99	NC_021823	TTA	2	6	5042	5047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865817
100	NC_021823	A	6	6	5120	5125	100 %	0 %	0 %	0 %	525865817
101	NC_021823	GGTT	2	8	5143	5150	0 %	50 %	50 %	0 %	525865817
102	NC_021823	AAAC	2	8	5498	5505	75 %	0 %	0 %	25 %	525865817
103	NC_021823	ATC	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865817
104	NC_021823	ATT	2	6	5609	5614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865817
105	NC_021823	TCT	2	6	5652	5657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865817
106	NC_021823	A	6	6	5661	5666	100 %	0 %	0 %	0 %	525865817
107	NC_021823	GTC	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865817
108	NC_021823	CTT	2	6	5823	5828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865817
109	NC_021823	TACT	2	8	5930	5937	25 %	50 %	0 %	25 %	525865818
110	NC_021823	TAA	2	6	5979	5984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865818
111	NC_021823	CTGAA	2	10	5990	5999	40 %	20 %	20 %	20 %	525865818
112	NC_021823	ATGG	2	8	6031	6038	25 %	25 %	50 %	0 %	525865818
113	NC_021823	GAT	4	12	6048	6059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865818
114	NC_021823	TGA	2	6	6090	6095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865818
115	NC_021823	GAA	2	6	6157	6162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865818
116	NC_021823	CAAAT	2	10	6215	6224	60 %	20 %	0 %	20 %	525865819
117	NC_021823	GAA	3	9	6247	6255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865819
118	NC_021823	GACGGC	2	12	6307	6318	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525865819
119	NC_021823	GAAA	2	8	6329	6336	75 %	0 %	25 %	0 %	525865819
120	NC_021823	A	6	6	6344	6349	100 %	0 %	0 %	0 %	525865819
121	NC_021823	ATT	2	6	6415	6420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865819
122	NC_021823	GCA	2	6	6511	6516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865819
123	NC_021823	AAG	2	6	6518	6523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865819
124	NC_021823	GGC	2	6	6541	6546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525865819
125	NC_021823	CGA	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865819
126	NC_021823	TCGA	2	8	6597	6604	25 %	25 %	25 %	25 %	525865819
127	NC_021823	CAG	2	6	6731	6736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865819
128	NC_021823	CAAA	2	8	6933	6940	75 %	0 %	0 %	25 %	525865819
129	NC_021823	AGA	2	6	7074	7079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865819
130	NC_021823	ATG	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865819
131	NC_021823	A	6	6	7147	7152	100 %	0 %	0 %	0 %	525865819
132	NC_021823	GGT	2	6	7180	7185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525865819
133	NC_021823	CATT	2	8	7196	7203	25 %	50 %	0 %	25 %	525865819
134	NC_021823	CAA	2	6	7240	7245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865819
135	NC_021823	AGC	2	6	7344	7349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865819
136	NC_021823	TGA	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865819
137	NC_021823	TAA	2	6	7379	7384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865819
138	NC_021823	ATA	2	6	7385	7390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865819
139	NC_021823	CTG	2	6	7397	7402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865819
140	NC_021823	CGG	2	6	7452	7457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525865819
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142	NC_021823	TAT	2	6	7601	7606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865820
143	NC_021823	AAT	2	6	7664	7669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865820
144	NC_021823	AAT	2	6	7839	7844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865820
145	NC_021823	AGCA	2	8	7990	7997	50 %	0 %	25 %	25 %	525865820
146	NC_021823	CAT	2	6	8094	8099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865820
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149	NC_021823	GATC	2	8	8274	8281	25 %	25 %	25 %	25 %	525865820
150	NC_021823	ATC	2	6	8324	8329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865820
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152	NC_021823	AAT	2	6	8452	8457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865820
153	NC_021823	TCA	2	6	8480	8485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865820
154	NC_021823	TTA	2	6	8501	8506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865820
155	NC_021823	TGA	2	6	8527	8532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865820
156	NC_021823	TAT	2	6	8739	8744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865821
157	NC_021823	A	6	6	8746	8751	100 %	0 %	0 %	0 %	525865821
158	NC_021823	TGG	2	6	8772	8777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525865821
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160	NC_021823	TTG	2	6	8801	8806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865821
161	NC_021823	TTA	2	6	8813	8818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865821
162	NC_021823	TAG	2	6	8855	8860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865821
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166	NC_021823	TTA	2	6	9016	9021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865821
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249	NC_021823	ATAA	2	8	12905	12912	75 %	25 %	0 %	0 %	525865824
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251	NC_021823	TTCT	2	8	13201	13208	0 %	75 %	0 %	25 %	525865824
252	NC_021823	CAG	2	6	13237	13242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865824
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255	NC_021823	AGT	2	6	13346	13351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865824
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257	NC_021823	AAG	2	6	13375	13380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865824
258	NC_021823	AGTT	2	8	13463	13470	25 %	50 %	25 %	0 %	525865824
259	NC_021823	GTT	2	6	13483	13488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865824
260	NC_021823	TTG	2	6	13529	13534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865824
261	NC_021823	T	7	7	13540	13546	0 %	100 %	0 %	0 %	525865824
262	NC_021823	GAT	2	6	13975	13980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865825
263	NC_021823	AAG	2	6	14027	14032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865825
264	NC_021823	AGC	2	6	14035	14040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865825
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267	NC_021823	AGA	2	6	14110	14115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865825
268	NC_021823	A	6	6	14137	14142	100 %	0 %	0 %	0 %	525865825
269	NC_021823	A	6	6	14166	14171	100 %	0 %	0 %	0 %	525865825
270	NC_021823	TATG	2	8	14233	14240	25 %	50 %	25 %	0 %	525865825
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381	NC_021823	T	7	7	19551	19557	0 %	100 %	0 %	0 %	525865831
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387	NC_021823	T	7	7	20019	20025	0 %	100 %	0 %	0 %	525865832
388	NC_021823	GAA	2	6	20026	20031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865832
389	NC_021823	AATCAC	2	12	20054	20065	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525865832
390	NC_021823	CTT	2	6	20101	20106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865832
391	NC_021823	T	8	8	20105	20112	0 %	100 %	0 %	0 %	525865832
392	NC_021823	CGA	2	6	20131	20136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865832
393	NC_021823	TTC	2	6	20148	20153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865832
394	NC_021823	CTC	2	6	20156	20161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525865832
395	NC_021823	CTT	2	6	20203	20208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865832
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398	NC_021823	TTC	2	6	20300	20305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865832
399	NC_021823	CTT	2	6	20365	20370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865832
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401	NC_021823	CATTT	2	10	20463	20472	20 %	60 %	0 %	20 %	525865832
402	NC_021823	T	7	7	20470	20476	0 %	100 %	0 %	0 %	525865832
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